Потому как потребность ограничить права супруга практически никогда не возникает при полном согласии супругов, остается только второй вариант: исковое заявление в суд.
Кстати, аналогичная тема о проблемах отражения в реестре совместных прав обсуждается сейчас на форуме Банкир.Ру
http://www.bankir.ru/ubb/Forum1/HTML/000583.html